Gli animali sono entità all'interno della mappa di gioco e fungono da minaccia o da risorsa per il giocatore. Cacciando animali infatti è possibile ricevere crediti. Gli animali in Far Cry 3: Blood Dragon si dividono in 3 categorie: i predatori, le prede aggressive, le prede pacifiche e gli animali ambientali. I predatori attaccheranno il giocatore a vista, le prede aggressive attaccheranno il giocatore solo se provocate, le prede pacifiche invece si limiteranno a fuggire o ad ignorare il giocatore. Ecco una lista completa degli animali di Far Cry 3: Blood Dragon. In questo capitolo ci sono 15 specie diverse di animali, contando anche i Blood Dragon.